Местность в Сабахе довольно гористая. В 138 км к северо-востоку от Кота-Кинабалу расположена самая высокая точка Юго-Восточной Азии - гора Кинабалу (4101 м). Гора Кинабалу входит в пятёрку самых молодых гор невулканического происхождения и по сей день высота горы ежегодно увеличивается на 5 мм. Несмотря на приличную высоту, Кинабалу легко доступна. Забраться на неё можно без специального оборудования, но всё же для восхождения туристам необходимо заказать услуги сопровождающего. Ежегодно тысячи туристов совершают восхождение, которое занимает 2-3 дня. На высоте 2000 м, среди зарослей рододендрона, расположен лагерь, к которому проведено электричество и подаётся по трубопроводу фильтрованная вода. Восхождение на гору Кинабалу начинается в Национальном парке Кинабалу, который расположен недалеко от туристического лагеря. Парк занимает площадь в 754 кв. км. Для его посещения требуется получить специальное разрешение. В парке можно путешествовать по джунглям по подвесным мостам, находящимся на высоте 20 м, отправиться к горячим источникам, знаменитым своими целительными свойствами, и к водопадам. Здесь обитают эндемичные гигантские красные черви кинабалу, длина которых может достигать 30 см, и серо-голубые кольчатые черви длиной до 70 см.

Южнее города Кота-Кинабалу находится Центр Раффлезия, где рассказывается о природном мире покрывающих остров лесов и о гигантском растении раффлезия, цветы которого имеют массу около 10 кг.

Прибрежные воды Кота-Кинабалу охраняются двумя национальными парками: Тунку-Абдул-Рахман (Tunku Abdul Rahman) и Палау-Тига (Pulau Tiga). Национальный парк Тунку-Абдул-Рахман раскинулся на 5 островах (Манукан, Мамутик, Сулуг, Гайя и Сапи) и их акваториях на площади в 49 кв. км, три четверти из которых приходятся на водную поверхность. Исследовать подводный мир парка могут даже неподготовленные дайверы. Самым большим из островов парка является остров Гайя. Для размещения туристам здесь предлагается 5-звёздочная гостиница. Остров Манукан популярен среди местных жителей. Его инфраструктура наиболее развита: на острове находится около 20 гостевых домов, дайв-центры и рестораны.

Остров Сапи славится своими протяжёнными песчаными пляжами, здесь в дневное время до отхода последнего парома скапливаются толпы туристов, желающих понежиться на солнышке и понырять в прибрежных водах. Остров Сулуг наиболее удалён от Кота-Кинабалу. Здесь любят отдыхать иностранные туристы. Помимо подводного мира на островах Гайя и Сапи предлагаются пешие маршруты по тропическим лесам, в ходе которых вы увидите разнообразных животных, в том числе сорных кур, которые могут мяукать, как кошки.